吉林大学民族研究所成立于2009年6月，2020年12月获批为国家民委中华民族共同体研究基地。
研究所依托中国史学科，研究人员跨历史学、民族学、文学、新闻学、艺术学等多个人文社科优势学科。主要研究方向为东北民族史、辽金史、边疆史，以东北民族为核心，延伸到其他边疆民族的历史与现代问题，利用文献、考古、调查材料，从历史学、民族学、人口学、体质人类学、文化人类学、社会学、宗教学、语言学、民俗学等多角度展开研究，在民族史领域积淀厚重、成果丰富，特别是对中国东北民族史和辽金史的研究，学术实力雄厚、研究时段完整、学术梯队均衡。吉林大学民族研究所已成为东北地区民族学研究的重镇。
